随着经济条件的提高，生活品质的改善，越来越多的家庭开始饮用商品化的桶装水（包括纯净水、饮用水和矿物质水等），饮水机也如雨后春笋般进入了越来越多人的家庭和社会公共场所。长期以来，人们都把卫生要求集中在桶装水的水质上，却忽略了饮水机自身的清洁。据业内人士估计，在数十万家庭和办公室用户中，有近半数很少或从未对饮水机进行过清洗，不少用户的饮水机内卫生较差，稍加清洗就有黄色污水流出，更有的饮水机里长出了青苔和绿藻。环境卫生监测部门检测显示，饮水机内胆如长时间不消毒或清洗，机内的储水胆会大量繁殖滋生细菌、病毒、沉淀残渣、重金属甚至滋生红虫，严重危害人们的身体健康。由此饮水机的二次污染已成为我们生活的一大隐患。
      饮水机的二次污染主要是有以下几个方面引起的：
首先，饮水机为空气压力原理，取水的同时等量空气也随之进入饮水机内部。不仅带入大量空气中的灰尘杂质，并且空气中含有的各种细菌也会随之进入。专家介绍即使清洁的空气中也有4000万个/平方米细菌。由于桶装水中的水都是通过压力压到饮水机中一个盛水的“内胆”中的，因此长时间存水后必然会有细菌滋生。
      其次，饮水机的工作流程通常是将桶装水的桶颈倒过来后放在饮水机的“聪明座”上，然后由机内的分水胆安装的软管流入冷热水胆内，这两个水胆除了起到出冷热水的功能外，还可起到沉淀水中杂质的作用。人们通常在桶装水喝完后，只重新换上一桶，却忽视了饮水机内胆还存有近1000毫升的水，久而久之，这些残余的水会成为细菌和病毒滋生的温床，影响影响用户的饮水安全。
      再次，饮水机的进水口和出水口与大气接触，也时常附着有菌，特别是当桶装水的瓶口不干净，进水口处就更容易受污染。另外，饮水机的冷热出水口若不经常清洗，也容易滋生微生物，有研究表明，经过一定时间冷水出口的微生物数量明显高于热水出口的微生物数量。
      专家提醒，一定要对饮水机进行定期清洗，最好是三个月清洗一次。如果长期使用而不消毒，再好的饮水机也会污染饮用水。即使是抑菌型的饮水机，长期使用的滤芯也会受污染。目前，饮水机的清洗现已被纳入商家售后服务范围，市民在购买纯净水的同时，可以向销售商提出清洗饮水机的要求，商家一般可提供免费上门清洗。平时，用户也可以用盐和食醋或食用消毒水自己进行清洗，其原理和清洗热水瓶内胆类似。
      下面介绍一种简便常用的饮水机清洗方法——药片清洗。具体的清洗过程是：先打开饮水机后面的排污管，并打开所有开关以排空所有的剩水，将1片去污泡腾片溶解在2升左右的清水里制成消毒液，可以用一小部分消毒液擦洗饮水机的各部位，其余的灌入胆内，过15－20分钟后，再打开饮水机的开关和排污管，排尽消毒液，用7－8升的清水多次冲洗内胆就可以了。这种含氯的去污泡腾片可以有效杀灭大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、白色念珠菌等病菌。